Le lycopène appartient à la classe des caroténoïdes. On le trouve en forte concentration dans les tomates (Solanum lycopersicum, dont il tient son nom) comme dans les cynorrhodons. Cette substance végétale appartient à la famille des tétraterpènes et possède, en raison de sa structure polyénique, une couleur rouge qui confère également aux tomates leur coloration caractéristique.
Le lycopène compte, avec l'alpha et le bêta-carotène, parmi les principaux caroténoïdes qui font partie des substances végétales secondaires. Si le concentré de tomates et le jus de tomate sont particulièrement riches en lycopène, on le trouve également présent dans les abricots, les pêches, les mangues, les pastèques, les baies, les courges, les agrumes et surtout les pamplemousses.