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Les défenses immunitaires sont un système complexe dont la performance et le fonctionnement dépendent de plusieurs facteurs. Idéalement, les défenses immunitaires ne sont dirigées que contre les cellules étrangères à l'organisme, comme les bactéries, les virus, les parasites ou les champignons, de même que contre les substances nocives de l'environnement ou encore contre les modifications cellulaires pathologiques propres à l'organisme. Les maladies auto-immunes sont des processus inflammatoires chroniques au cours desquels le système immunitaire s'attaque à tort aux cellules saines en endommageant ou en détruisant partiellement les propres tissus de l'organisme.